Mari Sonoda menuju ke toko kebersihan Keitaro bersama keponakannya Jotaro dan bertemu Naoya dan Masato, yang telah kembali. Sementara itu, Smart Brain yang telah menjadi organisasi pemerintah telah bertransformasi menjadi sebuah perusahaan yang bertujuan untuk memusnahkan seluruh kehidupan Orphnoch, dan operasi ini dipimpin oleh Kitazaki.
Untuk melindungi Orphnoch dari kepunahan, Masato Kusaka bertarung melawan penegak Smart Brain, Rena Kurumi. Tidak hanya itu, dia dibantu oleh Takumi Inui sendiri, yang telah menghilang bertahun-tahun yang lalu dan kembali sebagai Kamen Rider NEXT Faiz untuk menjadi ujung tombak Smart Brain...!
Mari dan yang lainnya kebingungan setelah diserang oleh Faiz yang baru. Mengapa Takumi bekerja dengan Smart Brain? Apa yang dia lakukan sejak itu? Reuni mereka yang penuh gejolak menandai awal dari kisah baru yang melibatkan Orphnochs dan umat manusia.
